秘传组织对犹大兴趣极大，如许多诺斯底派系。爱任纽记录了一个诺斯底派系的信仰，该隐派认为犹大是索菲亚神圣智慧的工具，导致造物主的嫉恨。他对耶稣的背叛胜过了物质世界。该隐派日后分裂成两派，对耶稣终极意义产生分歧。
《猶大福音》
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《猶大福音》失傳已久，原文應由希臘文寫成，但在1978年有人在埃及贝尼马萨[71]附近的洞穴中發現，是古柯普特文莎草纸的譯本。經碳14測定確定為公元280年（誤差±50年）的文本[72][73]。2006年4月，美国《国家地理》将其出版，并冠名《犹大福音》时引发世界轰动。该版包含支离破碎的抄本图像和相关专家和观察人员的分析注释，但没有完全翻译。文章介绍称：“失传了1,700年之久的古老文字称耶稣的背叛者是他最真挚的门徒[74]。”其中記述猶大應耶穌的要求而出賣耶穌，目的是為了幫助耶穌蛻除肉體的束縛，從而釋放神性。文章也给出证据，认为原始文档约在公元二世纪：“在公元180年左右，里昂主教爱任纽在当时的罗马高卢，写了长篇大论《反对异端》[75]，其中他攻击一部‘虚构历史’，‘仿造犹大福音的风格。’”[76]。
在杂志出版之前，其他新闻媒体也做出类似报道，节选了一部分内容公布[58]。
2007年12月，艾谱莉·德柯尼克在《纽约时报》的社论对页版发表文章，认为《国家地理》翻译有严重瑕疵：例如，《国家地理》译本称犹大是“daimon”，专家翻译成了“spirit”。但普遍来说，“spirit”对应的是“pneuma”，而在诺斯底文献中“daimon”总是对应为“demon”[77]。国家地理协会回应道：“艾谱莉·D·德柯尼克所提及的所有翻译问题都在流行本和评论本中加以脚注[78]。”在随后的研究和相关出版中，评论家琼·阿柯希娜质疑不可告人的秘密是否取代了历史分析，如发表《犹大福音》是不是想要撤回古代反犹主义罪名。她认为当下经文原旨主义和修正主义之间的冲突实在是幼稚，因为经文不可信。因此，她断言：“人们一边解释一边诈骗。问题不是修正《圣经》而是修正我们自己[79]。”另一些学者质疑《国家地理》专家对《犹大福音》最初的译文和解释[59]。
《巴拿巴福音》
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据中世纪《巴拿巴福音》副本（最早的为15世纪），钉十字架的不是耶稣而是犹大。它称犹大与耶稣换脸，而遭到背叛的耶稣被罗马軍隊拿去后升入天堂。换脸后的犹大与耶稣十分相像，以至于门徒和耶稣的母亲玛利亚都没认出来。犹大的身体被埋三天后被盗，耶稣死而复活的流言遍地。耶稣在第三重天得到消息，祷告上帝回到世界，与众人团聚，说明真相。之后，耶稣再次升入天堂，末了以正义君王身份降临。
该福音被大多数基督徒认为是后期伪造的假货；不过，一些学者认为它存留了一些先前的伪经成分（可能是诺斯底、以便尼或四福音合参），编造出与回教教条相近的故事。一些回教徒认为它包含了原始使徒压抑的版本。一些回教组织对此引述来支持回教版尔撒观。
《以馬內利的教誨》
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1963年，希臘天主教的神父伊薩·拉希德在耶路撒冷附近的一座山的斜坡上找到了一處小墓穴，他的朋友兼隨行人員的幽浮學家比利·麥爾在墓穴中挖出了一個用動物皮和樹脂包裹的捲軸，捲軸已經腐爛絕大部分只剩36章，經過兩人確認是一份的用阿拉姆語寫成的古老傳記，大約已有兩千的歷史[80]。在1973年，捲軸原稿在贖罪日戰爭中被燒毀，神父伊薩·拉希德也在不久之後身亡，所幸他有留下捲軸的副本和德文翻譯稿，兩樣東西都交由比利·麥爾保存。
在捲軸中耶穌被稱為「以馬內利」，捲軸顯示耶穌是預言中的彌賽亞，但他不是聖子而是先知，而在背叛耶穌的部分捲軸內容只有寫背叛和賣了耶穌的人是法利賽人沒有明確寫是加略人猶大出賣了耶穌，可是加略人猶大在捲軸中一些部分被稱為「猶大·伊哈略」(Juda Ihariot)，意思為「法利賽人猶大」，在一些部份又被稱為加略人猶大(Judas Iscariot)[81]，因此一些研究者認為出賣耶穌的法利賽人就是猶大，另一些學者認為猶大·伊哈略與加略人猶大並不是同一個人[82]，這個觀點在比利·麥爾的著作《塔木德·伊曼紐爾》中得到他的認同[83]，也有一些學者則認為法利賽人指的是加略人猶大的父親西門，是父親西門出賣了耶穌而不是兒子猶大，更有一些學者認為加略人猶大是捲軸的作者，還有一些學者認為捲軸與翻譯稿等一切都只是比利·麥爾的騙局。
這份捲軸沒有受到天主教、東正教、新教、猶太教的承認，一些基督徒認為這只是基於馬太福音的偽作。